Como parte del proceso para evaluar la efectividad del manejo de las áreas protegidas que conforman el Sistema de Parques Nacionales de Colombia, se puso a prueba la metodología de evaluación de integridad ecológica de Parrish et al. (2003) y Herrera AND Corrales (2004) en un conjunto piloto de cinco áreas protegidas. La prueba consistió en un ejercicio participativo con expertos, para ajustar cada uno de los pasos metodológicos de acuerdo con las condiciones particulares de los Parques Nacionales Naturales en Colombia. Se modificaron los criterios para limitar el número de objetos de conservación, incluyendo un criterio secundario relacionado con uso de biodiversidad. Se desarrolló además una propuesta de selección y evaluación de atributos ecológicos clave y un mecanismo para establecer los rangos aceptables de variación, basados en un árbol de decisiones que contrasta los indicadores con una línea de referencia. Finalmente, se ajustaron las descripciones para el índice de integridad ecológica de acuerdo con los requerimientos de manejo de los Parques Nacionales Naturales de Colombia y se evaluaron los doce indicadores con más factibilidad de medición para analizar Integridad Ecológica, correspondientes a objetos de conservación asociados a paisajes/ecosistemas y especies/poblaciones, tomando en cuenta sus características de pertinencia, credibilidad, factibilidad, claridad y utilidad comparativa. Además y como anexos van a ir las hojas metodológicas, cada una con sus correspondientes autores. Este documento será el cuarto cuadernillo del documento de efectividad que se público en 2005 por Parques Nacionales